佛学大辞典

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(一)又作本寺、本刹。其义有二：(一)指本来所住之山寺。(二)犹言当山、当寺，即此寺之意。
　(二)日本佛教用语。又称为本寺、祖山。为对于各宗派根本道场之称。本山，即根本山寺之意，意谓一宗传灯付法之根本道场。又有总本山、大本山、中本山、别格本山、准别格本山等区别。隶属其下之寺院，则称末山、末寺。末寺亦有孙末、彦末、直末之区别。属于本山之一部分；但另行构筑之寺宇，则称别院。 更多：https://www.bmcx.com/
　本山之称，始于平安时代（794～1192），当时天台宗以比睿山延历寺为传法中心，真言宗以高野山金刚峰寺为中心，各领有众多寺院，故有本末之称。后其他宗派亦套用此称。［考信录卷一、日本宗教制度史料类聚考］